Micropep is building a more sustainable agriculture for future generations. We develop natural crop protection solutions based on the incredible potential of micropeptides, small natural protein molecules that target and regulate plant genes and proteins. We are building the next generation of sustainable solutions for farmers who care about their crops and the future of our planet.

Micropep was founded in 2016 as a spin-off of "LRSV", a French plant research laboratory associated with the National Center for Scientific Research (CNRS) and the University of Toulouse, a center of excellence in AgriTech. To date, Micropep has raised nearly $60 million from leading European and American investors and began its expansion into the United States in 2022.

We are a team of over 50 accomplished and motivated individuals from diverse scientific, technical, and business backgrounds, united by our desire to leave a positive impact on our planet. Together, we are revolutionizing crop protection through our proprietary micropeptide technology.

You will join an interdisciplinary R&D team where Artificial Intelligence is the central engine of our active molecule discovery.

Your Mission: Technical Expert & AI Ambassador

Beyond model design, you will be the company's Go-To AI Reference. Your role is dual:

1.  Operational: Design and deploy predictive models (peptide design, property prediction) with pragmatism and mathematical rigor.

2.  Strategic: Embody the company's technological expertise. You will be the key contact point for AI topics, both to align internal teams and to establish the credibility of our approach with external partners.

Responsibilities

AI / Machine Learning Development

• Develop, train, and optimize Machine Learning / Deep Learning models applied to peptides.

•  Handle and analyze large biological datasets (classification, regression, embeddings).

• Evaluate, compare, and document model performance in scientific and technical reports.

• Utilize, adapt, and improve modern architectures: transformers, protein LLMs, autoencoders, VAEs, GNNs…

• Prepare the necessary data for model training, specifically:

  • define data structuring and pre-processing steps in collaboration with the data engineering team,

  • critically analyze data validity, consistency, and potential biases, 

  • identify the most relevant data sources for the models used.      

In Silico Peptide Design

• Design peptides meeting the objectives defined by project teams.

• Integrate biological, experimental, and regulatory/IP constraints, as well as scientist feedback, into the design process.

• Determine the best strategy to leverage available models to guide and optimize peptide generation.

MLOps & Industrialization

• Build to last: Industrialize your models into reproducible and scalable pipelines (CI/CD, Docker, Cloud).

• Collaborate with the engineering team to ensure data flow integrity and transform research algorithms into reliable production tools.

AI Reference & Outreach (Internal/External)

• Internal: Act as a true technological "Business Partner" for biologists and leadership. Popularize technical choices, evangelize best practices, and align the AI roadmap with product strategy.

• External: Represent the company's scientific excellence. Lead collaborations with academic or technical partners and maintain active monitoring to capture breakthrough innovations.

Required Skills

Technical Skills

• Solid knowledge in AI, Machine Learning, and Deep Learning, with a strong understanding of modern architectures (transformers, encoders, autoencoders…).

• Experience in model training: cross‑validation, hyperparameter optimization, ML pipelines.

• Proficiency in database management and exploration (cleaning, structuring, EDA).

• Bioinformatics skills or a strong sensitivity to biological data.

• Appreciated knowledge in structural biology, peptides, sequences, and representations (embeddings).

• Appreciated knowledge in Cloud Computing

Scientific Skills

• Excellent scientific rigor: robust analyses, reproducibility, clear documentation.

• Ability to read, interpret, and synthesize advanced scientific literature.

Interpersonal / Organizational Skills

• A sense of "Scientific Service": You understand that AI serves the product. You are pragmatic and ROI-oriented.

• Communicator & Educator: You are comfortable explaining complex concepts to non-experts and carrying the company's voice externally.

• Passionate Explorer: Curious and proactive, you love breaking new ground while keeping focus on concrete applications.

• Autonomy, sense of priorities, and ability to evolve in a multi‑project environment.

Candidate Profile

• Master's degree to PhD in AI, mathematics, computational biology, data science, or a related field.

• 5+ years of practical experience, ideally in a scientific (BioTech, Pharma) or demanding industrial context.

• Mathematical & Code Expertise: You master the theory "under the hood" and you code cleanly (Python, PyTorch/TensorFlow, MLOps).

• Practical experience with models applied to proteins or peptides is a significant plus.

• Marked interest for interdisciplinarity, complex data, and R&D environments.

What We Offer

• A central role: You are the face of AI at Micropep.

• Impact: Your algorithms become real products.

• The environment: The agility of a startup, the resources of a tech SME, and a passionate team.

• Attractive package (Competitive salary + Bonus) and flexible partial remote work policy.

Micropep construit une agriculture plus durable pour les générations futures. Nous développons des solutions naturelles de protection des cultures basées sur l'incroyable potentiel des micropeptides, petites molécules protéiques naturelles qui ciblent et régulent les gènes et les protéines des plantes. Nous construisons la prochaine génération de solutions durables pour les agriculteurs qui se soucient de leurs cultures et de l'avenir de notre planète.

Micropep a été fondée en 2016 en tant que spin-off de "LRSV", un laboratoire français de recherche sur les plantes du Centre national de la recherche scientifique (CNRS) et de l'Université de Toulouse, un centre d'excellence en AgriTech. A ce jour, Micropep a levé près de 60 millions de dollars auprès d'investisseurs européens et américains de premier plan et a commencé son expansion aux Etats-Unis en 2022.

Nous sommes une équipe de plus de 50 personnes accomplies et motivées, issues de différents horizons scientifiques, techniques et commerciaux. Nous sommes unis par notre désir de laisser un impact positif sur notre planète. Ensemble, nous révolutionnons la protection des cultures grâce à notre technologie exclusive des micropeptides.

Vous intégrerez une équipe R&D interdisciplinaire où l'Intelligence Artificielle est le moteur central de notre découverte de molécules actives.

Votre Mission : Expert Technique & Ambassadeur IA

Au-delà de la conception de modèles, vous serez le Référent IA incontournable de la société. Votre rôle est double :

1. Opérationnel : Concevoir et déployer des modèles prédictifs (design de peptides, prédiction de propriétés) avec pragmatisme et rigueur mathématique.

2. Stratégique : Incarner l'expertise technologique de l'entreprise. Vous serez le point de contact privilégié pour les sujets IA, tant pour aligner les équipes internes que pour crédibiliser notre approche auprès de nos partenaires externes.

Responsabilités

Développement IA / Machine Learning

• Développer, entraîner et optimiser des modèles de Machine Learning / Deep Learning appliqués aux peptides.

• Manipuler et analyser de larges ensembles de données biologiques (classification, régression, embeddings).

• Évaluer, comparer et documenter la performance des modèles dans des rapports scientifiques et techniques.

• Utiliser, adapter et améliorer des architectures modernes : transformers, LLMs protéiques, autoencodeurs, VAEs, GNNs…

• Préparer les données nécessaires à l’entraînement des modèles, notamment :

  • définir avec l’équipe data engineering la structuration des données et les étapes de pré‑traitement,

  • analyser de manière critique la validité, la cohérence et les biais potentiels des données,

  • identifier les sources de données les plus pertinentes pour les modèles utilisés.

Design in silico de peptides

• Concevoir des peptides répondant aux objectifs définis par les équipes projet.

• Intégrer les contraintes biologiques, expérimentales, réglementaires/IP ainsi que les retours des scientifiques dans la conception.

• Déterminer la meilleure manière d’exploiter les modèles disponibles pour guider et optimiser la génération de peptides.

MLOps & Industrialisation

• Construire pour durer : Industrialiser vos modèles en pipelines reproductibles et scalables (CI/CD, Docker, Cloud).

• Collaborer avec l’équipe d’engineering pour garantir l'intégrité des flux de données et transformer nos algorithmes de recherche en outils de production fiables.

Référent IA & Rayonnement (Interne/Externe)

• En Interne : Agir comme un véritable "Business Partner" technologique auprès des biologistes et de la direction. Vulgariser les choix techniques, évangéliser les bonnes pratiques et aligner la roadmap IA sur la stratégie produit.

• En Externe : Représenter l'excellence scientifique de l'entreprise. Piloter les collaborations avec nos partenaires académiques ou technologiques et assurer une veille active pour capter les innovations de rupture.

Compétences requises

Techniques

• Solides connaissances en IA, Machine Learning et Deep Learning,
  avec une bonne compréhension des architectures modernes (transformers, encoders, autoencodeurs…).

• Expérience en entraînement de modèles : cross‑validation, optimisation d’hyperparamètres, pipelines ML.

• Maîtrise de la gestion et exploration de bases de données (nettoyage, structuration, analyse exploratoire).

• Compétences en bioinformatique ou forte sensibilité aux données biologiques.

• Connaissances appréciées en biologie structurale, peptides, séquences et représentations (embeddings).

• Connaissances appréciées en Cloud Computing

Scientifiques

• Excellente rigueur scientifique : analyses robustes, reproductibilité, documentation claire.

• Capacité à lire, interpréter et synthétiser la littérature scientifique avancée.

Relationnelles / organisationnelles

• Le sens du "Service" Scientifique : Vous comprenez que l'IA est au service du produit. Vous êtes pragmatique et orienté résultat (ROI).

• Communicant & Pédagogue : Vous êtes à l'aise pour expliquer des concepts complexes à des non-experts et pour porter la voix de l'entreprise à l'extérieur.

• Explorateur Passionné : Curieux et proactif, vous aimez défricher de nouveaux territoires tout en gardant le cap sur l'application concrète.

• Autonomie, sens des priorités et capacité à évoluer dans un environnement multi‑projets.

Profil recherché

• Bac+5 à PhD en IA, mathématiques, biologie computationnelle, data science ou domaine connexe.

• 5+ ans d'expérience pratique, idéalement dans un contexte scientifique (BioTech, Pharma) ou industriel exigeant.

• Expertise Mathématique & Code : Vous maîtrisez la théorie "sous le capot" et vous codez proprement (Python, PyTorch/TensorFlow, MLOps).

• Une expérience pratique sur des modèles appliqués aux protéines ou peptides est un plus important.

• Intérêt marqué pour l’interdisciplinarité, les données complexes et les environnements R&D.

Ce que nous offrons

• Un poste central : Vous êtes le visage de l'IA chez nous.

• L'impact : Vos algorithmes deviennent des produits réels.

• L'environnement : L'agilité d'une startup, les moyens d'une PME technologique, et une équipe passionnée.

• Package attractif (Salaire compétitif + Bonus) et politique de télétravail flexible